Nach Angaben der Weltgesundheitsorganisation WHO sind bei weltweit mehr als 270 Millionen verimpften Dosen der HPV-Impfung keine schweren Nebenwirkungen, die die Gesundheit nachhaltig beeinträchtigen, in einem ursächlichen Zusammenhang mit der HPV-Impfung festgestellt worden. Das zeigt: Die HPV-Impfung ist sicher.
Wie bei jeder anderen Impfung auch können nach der HPV-Impfung jedoch Nebenwirkungen auftreten. Die häufigsten Nebenwirkungen sind Schmerzen, Rötung und Schwellung an der Einstichstelle am Oberarm. Kopfschmerzen, Schwindel oder Abgeschlagenheit können auch in einer schweren Form auftreten, sind jedoch zeitlich begrenzt und verschwinden wieder vollständig. Diese Nebenwirkungen sind nicht häufiger als bei anderen klassischen Kinder-Impfungen auch und zeigen, dass der Körper sich mit dem Impfstoff auseinandersetzt. Vereinzelt kann es zu schweren allergischen Reaktionen (WHO: ca. 1,7 Fälle pro eine Million Impfungen) kommen. Teilweise wird Jugendlichen bei der Impfung schwindelig, deswegen sollte die Impfung immer im Sitzen oder Liegen verabreicht werden. Die Kreislaufreaktion hat meistens nichts mit der HPV-Impfung zu tun, sondern ist Ausdruck von Angst oder Stress im Zusammenhang mit der Impfung.
In Internetforen wird die HPV-Impfung immer wieder in Zusammenhang mit zwei Todesfällen aus dem Jahr 2007 gebracht. Das Paul-Ehrlich-Institut ist diesem Vorwurf gewissenhaft nachgegangen und konnte nach ausführlicher Untersuchung keine Anzeichen für einen ursächlichen Zusammenhang mit der HPV-Impfung feststellen. Die Ergebnisse können in einer ausführlichen Stellungnahme des Paul-Ehrlich-Instituts nachgelesen werden.
In einigen Internetforen taucht auch der Mythos auf, dass die HPV-Impfung zu einem »komplexen regionalen Schmerzsyndrom (CRPS)« oder dem »posturalen orthostatischen Tachykardiesyndrom (POTS)« führen kann. Auch dieser Vorwurf erwies sich als wissenschaftlich nicht haltbar. Hierzu stellt zum Beispiel die Europäische Arzneimittelbehörde ausführliche Analyseergebnisse zum Sicherheitsprofil der HPV-Impfstoffe zur Verfügung.